Web 上に存在する SEO ツールは、基本的には、こういった情報を自動的に取得してくるものである。当然、検索エンジン側に不具合が起きれば、異常値が表示されてしまう場合もある。そうした点から、ツールで取得できる情報は、参考程度に捉えておく方が無難だろう。
最近では、被リンク数、PageRank などの数値を基に、Web サイトの総合的な点数を算出してくれる SEO ツールも増えてはいるが、このようなツールを使う場合にも、算出されたサイトの点数を鵜呑みにすることはお勧めできない。あくまでも、参考程度に留めておくべきである。
例えば、検索結果に上位表示されていない Web サイトであっても、SEO ツール上の点数が高く表示される場合がある。これも、「検索エンジンが真に評価対象としている情報を、私達は正確には知ることができない」ということが原因で起きる現象だ。
上述の通り、私達は、検索エンジンの評価指標やアルゴリズムの全てを正確に把握することはできない。それは SEO ツールの開発者も同様である。そのため、ほとんどの SEO ツールでは、取得できる情報の中から、開発者がランキングの決定に関係のありそうなものをピックアップし、独自の評価を行う仕組みを取っている。